学科建设是提高学校办学水平和层次的关键。自动化学院把学科建设作为学院工作的重中之重，瞄准国家重大战略需求和区域经济社会发展需要，推进科技创新，不断提升原始创新能力和人才培养质量。

自动化学院以控制科学与工程、电气工程学科为主体，拥有2个本科专业：自动化、电气工程及其自动化（省特色专业），1个教育部预备案专业：探测制导与控制技术，1个专业硕士点：电子信息（控制工程085406）。

学院立足航空航天、适应民用工程，面向国防科技发展和河南省经济现代化建设的战略需求，服务河南“7+28”产业布局的要求，瞄准航空航天及卫星应用、智能装备、新型电力（新能源）装备的发展前沿，围绕导航制导与控制、控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、现代电力系统工程等4个学科方向进行建设。